Selain kerjasama di tingkat nasional, WWF juga berperan aktif dalam inisiatif perlindungan internasional. Lembaga ini menjalankan kolaborasi dengan pemerintah Tiongkok melalui program TRAFFIC, yaitu program global yang berfokus pada pemantauan perdagangan satwa liar, pembelajaran lingkungan, serta peningkatan kesadaran konsumen agar tidak membeli produk dari hasil perburuan ilegal.
Sementara di kawasan Asia Tenggara, kerjasama dilakukan melalui ASEAN Wildlife Enforcement Network (ASEAN-WEN), sebuah jaringan antarnegara anggota ASEAN yang berfungsi memperkuat penegakan hukum terhadap perdagangan satwa liar ilegal lintas negara.
Melalui berbagai inisiatif tersebut, WWF-Indonesia bersama pemerintah Indonesia terus berupaya memutus rantai perdagangan satwa liar ilegal, menjaga kelestarian satwa endemik, serta memastikan bahwa keanekaragaman hayati Indonesia dapat terus diwariskan bagi generasi mendatang.